哈尔滨海关为海关总署垂直管理的正厅级直属海关，负责黑龙江省范围内海关工作运行管理、监督监控。主要职责是：负责本关区贯彻落实党中央、国务院关于海关工作的方针政策和决策部署，执行与海关管理相关的法律、法规、规章、规范性文件和相关技术规范，负责本关区征税、监管、缉私、统计、出入境检验检疫等工作；监控研判本关区各类执法风险、管理风险和廉政风险并组织防范和化解，负责本关区基层党组织建设、队伍建设和日常管理工作；完成海关总署交办的其他工作。

  哈尔滨海关机关内设处级机构18个，下设副厅级缉私局和隶属海关单位各1个，正处级隶属海关单位20个，设有10个党委派驻纪检组。

  哈尔滨海关辖区口岸分布点多线长面广，“水、陆、空、铁、管、网、邮、索”监管运输方式众多，业务特色鲜明。哈尔滨海关深入贯彻落实习近平总书记给红其拉甫海关全体关员重要回信精神、到龙江视察期间重要讲话重要指示精神，身在最北方，心向党中央，守国门、促发展，当好让党放心、让人民满意的国门卫士，各项工作取得了显著成效，为黑龙江省经济社会发展做出了积极贡献。